Fig. 1: Uso de DL para microscopía. Crédito: Comunicaciones de la naturaleza (2021). DOI: 10.1038 / s41467-021-22518-0
Una nueva plataforma gratuita ayuda a los no expertos a utilizar la inteligencia artificial para analizar imágenes microscópicas. La plataforma fue desarrollada en la Universidad de Åbo Akademi en Finlandia y el Instituto Gulbenkian de Ciência en Portugal y será de gran ayuda en la investigación y el diagnóstico utilizando microscopios modernos.
Software usando inteligencia artificial, AI, revolucionando la forma imágenes microscópicas son analizados. Por ejemplo, la inteligencia artificial se puede utilizar para detectar características en imágenes (es decir, tumores en muestras de biopsia) o para mejorar la calidad de la imagen eliminando el ruido no deseado. Sin embargo, los no expertos todavía encuentran que las tecnologías de inteligencia artificial son difíciles de usar.
En el artículo “Democratización aprendizaje profundo para microscopía con ZeroCostDL4Mic ”, publicado en Comunicaciones de la naturaleza El 15 de abril de 2021, los científicos describen una plataforma llamada ZeroCostDL4Mic que hace que estas tecnologías de IA sean accesibles para todos.
“La innovación clave es que ZeroCostDL4Mic se ejecuta en la nube de forma gratuita y no requiere experiencia en codificación ni habilidades informáticas avanzadas por parte de los usuarios. Funciona de manera eficiente en cualquier computadora con un navegador web ”, dice Guillaume Jacquemet, investigador senior de Biología en la Universidad Åbo Akademi.
Durante los últimos 400 años, los microscopios han hecho posible que la humanidad observe objetos que de otro modo serían demasiado pequeños para ser vistos a simple vista. Actualmente, la microscopía es la tecnología líder utilizada en todo el mundo no solo para la investigación, sino también para el diagnóstico.
Los microscopios modernos están conectados directamente a cámaras digitales, lo que da como resultado cientos o miles de imágenes por muestra. Estas imágenes deben procesarse en una computadora para obtener datos significativos, lo cual es una tarea enorme.
Para ayudar con la cantidad de imágenes, Jacquemet y sus colegas utilizaron inteligencia artificial para entrenar a la máquina para que hiciera el trabajo. En la práctica, ZeroCostDL4Mic es una colección de cuadernos legibles para Google Colab, equipados con una interfaz gráfica de usuario fácil de usar.
“Creemos que ZeroCostDL4Mic actuará como una ‘medicina’ para la IA, alentando a los usuarios a descubrir nuevas tecnologías que cambiarán la investigación y el diagnóstico biomédicos en las próximas décadas”, dice Jacquemet.
El desarrollo de la plataforma ZeroCostDL4Mic fue coordinado por los laboratorios de Guillaume Jacquemet (Universidad Åbo Akademi, Turku, Finlandia) y Ricardo Henriques (Instituto Gulbenkian de Ciência, Oeiras, Portugal). Asistió un gran consorcio internacional de 12 laboratorios repartidos en nueve países y dos continentes.
ZeroCostDL4Mic es disponible gratuitamente en Internet.
Lucas von Chamier y col. Democratización del aprendizaje profundo para microscopía con ZeroCostDL4Mic, Comunicaciones de la naturaleza (2021). DOI: 10.1038 / s41467-021-22518-0
Proporcionado por la Universidad Abo Akademi